巨星政策在帮助皇马一跃成为世界俱乐部首富的同时，也给皇马带来了没完没了的“更衣室纠纷”，当时，一场冠军联赛上，皇马因内耗，在主场输给了缺兵少将的阿森纳，此后又不敌排名靠后的马洛卡，这两场失利成为了弗洛伦蒂诺下课的导火索。
2006年2月27日，弗罗伦蒂诺宣布辞去皇马主席的职务，辞职后，他回归建筑商人的生活方式，远离公众关注，即便开口也决口不谈皇马，不谈足球。
然而，随着皇马影响力的削弱，随着皇马队内球星光芒逐渐黯淡，皇马球迷对这位“银河战舰”创造者的思念也日益加深。
2009年6月14日，弗洛伦蒂诺下定决心，通过选举重返皇马。一方面是因为俱乐部的需要，另一方面则是他建筑事业的需要。
弗洛伦蒂诺下定决心回到前台，重新执掌皇家马德里，可不是为了看到球队这么狼狈的样子，他要的不单单是巨星，还有荣誉，他要让皇家马德里成为21世纪最强大的俱乐部。
早在决定参选的时候，佛洛伦蒂诺就曾表示过：“我们有想法、有模式以及有激情带领俱乐部重新获得属于我们的荣誉。”
当初选择离开皇家马德里，弗洛伦蒂诺曾在接受采访的时候表示过：“我当时辞职是为了俱乐部的利益，但我承认这是一个错误的决定。在我执掌皇马的6年间，俱乐部从制度不稳定，经济和竞技都有问题变成全世界的模范，并且在竞技和经济方面都取得成功，我们重塑了皇家马德里的影像，我们巩固了皇马商标并使得它更受欢迎。”
“我面对的最迫切和最关键的问题是制定一套组织模式基础，要令未来任何人都无法破坏它，我会带着比过去更多的激情、更多的想法以及更强的力量回到俱乐部，我心中已经有一个令人兴奋的竞技计划，我将逐步消除俱乐部目前存在的不稳定性，也做好了准备迎接巨大的挑战。”
“我们正在执行一个伟大的计划，这将确保皇家马德里，继续成为世界上最伟大的俱乐部、21世纪最好的俱乐部。”
当初竞选时候的宣言，言犹在耳，皇家马德里这个赛季的战绩不能说是失败，但是联赛输给巴塞罗那，国王杯输给一支丙级队，现在好不容易闯进了欧冠决赛，佛洛伦蒂诺正憧憬着皇家马德里在他的带领下拿到第十座欧冠奖杯，结果比赛才开始不到一分钟，皇马的球门就被佛罗伦萨攻破了。
而且在接下来的这段时间里，他完全看不到球队任何改变，这让他对佩莱格里尼彻底失去了耐心。
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