沈志华在书中同时认为除了伤亡外，还有一个被俘数字。据几个参战团当时电报汇报「一梯队三个团在登陆时各俘获国民党青年军数百至千余俘虏。」因此伤亡6,100人和这近3,000俘虏合计9,000人以上，解放军战史称歼灭9,000多人，根据中国人民解放军战场统计传统，所谓歼灭是指击毙、击伤、俘虏等使之丧失作战能力的合计数。
影响与评价的争议
自解放军南渡长江後，兵败如山倒。陈诚秉承蒋之意志，在金门、厦门危急时，使罗卓英冒越权之名，向第十二兵团调用第十八军，不以之运台澎，以履行保卫台湾之使命，而使之赴金门，以增援当地守军，此乃大将「顾大局，救他人」之风范。
当厦门失守後，迅以第十二兵团急援金门。
空军总司令周至柔除空中支援外，并无地面作战之责任，但监於金门、厦门危急，千里应援，迅以机场警卫部队，编成两师，加入第二十二兵团之第二十五军，戍守前线。
海军、空军密切协同，大力支援，实为迅速收功之要因，事实俱在，功不可没。
在金门，空军对彼岸解放军之压制，使解放军不能调集船只，续行增援，抑且压制解放军Pa0火，使其无法S击。
海军总司令黎玉玺统率卓越，安定海域，使援军源源而来，且以猛烈火力，对胡琏有力支援，群策群力。
1949年10月27日，古宁头战役获胜消息传到台北，蒋中正流了泪说：「这一仗我们全胜了……台湾安全了。」
蒋对此战给予高度评价：「古宁头大捷，不仅保住了金门，更保住了台湾。」
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