按照尼堪之前的筹划，大夏国从其余三部抽调了大约一万户，并入博格拉部，占住了祁连山西麓主要以大通河流域为核心的地带，也就是历史上丝绸之路的南路，剩下的地方则被罕都、玛齐克、西科尔沁三部瓜分。
大夏国将河湟谷地划入青海，进驻一个军团，成立青海总督辖区，杨廷玉兼任总督。
在青海境内施行宗教自由政策，黄教、红教、萨满教都可以大大方方信仰，不过对于各重要地方的关键寺庙大活佛的转世制度进行了规范。
尼堪将后世的活佛转世制度提前用到了青海，凡是呼图克图以上级别的活佛，除了需要进行金瓶掣签制度，还要在接受中央政府，也就是大夏国皇帝册封后才能生效。
完全废除境内的农奴、牧奴身份，寺庙的僧众由信众与官府双重供奉。
对于罕都、玛齐克、西科尔沁三部还是施行羁縻制度，只在祁连山西麓施行大夏国的管辖制度。
以前的和硕特诸部，黄金家族后代自然都是黄教的笃信者，而西科尔沁不少人还是保留了信奉萨满教神衮的传统，接受大夏国的统治之后，干脆完全抛弃了喇嘛教，又回归了萨满教传统，这样一来，罕都的红教、玛齐克的黄教、西科尔沁的萨满教便三分天下。
而在大夏国直接管辖之下的祁连山东西两麓，儒教、喇嘛教、萨满教并行，不过在一系列学堂、工矿作坊建立起来后，比较醒目的大夏国高官，比如孙秀节、韩承影、洪承畴等人都意识到皇帝陛下施行的这一套，表面上对儒教、萨满教、喇嘛教都尊崇，实际上骨子里却是另外一套。
后来，也不知是谁首先叫起来的，对尼堪这一套命名了“新学”、“夏学”等称呼，最后干脆以“新教”名之。
尼堪得知后也未置可否，众人见状，干脆大胆用起了这个名字，一时间，大夏“新教”隐隐有超然卓立的迹象。
有好事者将新教进行了归纳，核心内容大致如下：
其一，鼓吹众生平等，天生我材必有用，人人可各尽其才，各安其业，只有分工的不同，没有高低贵贱；
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